Fakulta prírodných vied bola zriadená v roku 1998 ako pracovisko integrujúce predovšetkým matematikov a fyzikov, ale i pracovníkov z iných prírodovedných odborov za účelom skvalitnenia poskytovanej výučby predmetov teoretického základu pre iné fakulty ŽU. Hlavným účelom však bolo vytvorenie podmienok pre skvalitnenie vedecko-výskumnej aktivity týchto pracovníkov a tým aj vytvorenie možností pre uskutočňovanie vlastných študijných programov. Túto myšlienku sa podarilo realizovať iba čiastočne v podobe vybudovania matematického pracoviska.

Od roku 2000, kedy sa od Žilinskej univerzity odčlenila fakulta humanitného zamerania, pripadla Fakulte prírodných vied úloha rozvíjať humanitné vzdelávanie na ŽU a postupne budovať pracoviská humanitno-spoločenských vied. Preto sa v uplynulých rokoch profil fakulty dynamicky vyvíjal, budovali sa pracoviská so zameraním na humanitné a spoločenské vedy, rozšírilo sa spektrum ponúkaných študijných programov. Nové trendy v zameraní fakulty vychádzajú z potrieb praxe. Sú orientované na rozvoj takých študijných programov a aktivít, ktoré sú z hľadiska potrieb spoločnosti nevyhnutné, a ktoré sa práve pre prepojenie technických, technologických, humanitných a sociálnych aspektov nerozvíjajú v celej šírke na iných pracoviskách.

Vo svojej pedagogickej činnosti sa FPV ŽU orientuje hlavne na dve oblasti pôsobenia:

• výchovu vlastných študentov
• zabezpečenie výučby niektorých predmetov pre ostatné fakulty ŽU. Jedná sa predovšetkým o matematiku, cudzie jazyky a predmety humanitného a sociálneho zamerania.

Kým pri vzniku fakulty a v jej prvých rokoch existencie bola výrazná prevaha výučby na iných fakultách, s narastajúcim počtom vlastných študentov, a v súvislosti s redukciou počtu hodín teoretického základu na iných fakultách, sa ťažisko výučby presúva do oblasti výchovy vlastných študentov. Vo svojich vedeckovýskumných aktivitách sa pracovné kolektívy zameriavajú na tie oblasti, ktoré úzko súvisia s ich pedagogickým pôsobením.

Profilácia fakulty sa výrazne zmenila od vzniku fakulty, a tak jej názov nie je v súlade s tým, čo fakulta ponúka v oblasti vzdelávania, ani s orientáciou jej vedeckovýskumnej činnosti. Preto sa Fakulta prírodných vied usiluje o zmenu názvu.